                package:None                R Documentation


Description:

Este  um exerccio prtico para explorar dados e estimar riqueza de espcies dos dados de uma matriz que consiste em colunas com nomes de gnero, subgnero e espcie, e colunas com informao referente 
 localidade de coleta (urbana,rural),altitude (metros sobre nvel do mar) e lugar de coleta para imaturos de culicdeos.
A matriz de dados que foi utilizada tem as dimensoes de 853 linhas vs. 6 colunas (registros de espcies e pontos onde foram coletadas). As colunas: gnero, subgnero, espcie, altitude,
criadouro e localidade.A analise est subdividida em varios passos(steps) que exploram os dados e comparam a riqueza de espcies por localidade assim como a riqueza de espcies contida 
em cada um dos criadouros amostrados. De forma complementar, ou seja, adicional  funao, sao dadas funoes simples para comparar a relao entre variveis como: altitude vs. espcies; localidade vs. espcie e criadouro vs. localidade.
Para esclarecer a anlise feita, so anexados os arquivos com todos os cdigos utilizados (parte exploratria ), as funes para a anlise (em passos ou steps) e a matriz de dados original.

     
Usage:

     Anexploratoria(dados...)

X= matriz de dados ou database como descrita em Description


Arguments:
x= matriz de dados ou database em (.csv)

Details:

     A estimativa de riqueza utilizada na funo corresponde com a frmula:
Riqueza= Nmero de espcies por unidade amostral/Raz quadrada do total de indivduos por unidade amostral. Sabe-se de outras frmulas de riqueza propostas em textos de Ecologia, 
no entanto, para o objetivo de fazer uma anlise exploratria bsica, a frmula indicada se considerou adequada.

As unidades amostrais consideradas em esta funo correspondem com as categorias diferentes para Localidade que so: urbana e rural.
Para cada passo ou STEP da funo foi includa uma observao entre smbolos # que d a explanao devida.


Value:

    A funo retorna a seguinte lista:
1. STEP1= Tabelas de relao entre variveis: gnero vs. localidade; espcie vs. criadouro; gnero vs. altitude; subgnero vs. criadouro;
   e finalmente uma tabela de proporoes que ajuda a observar a frequencia das espcies em cada criadouro.

2. STEP2= Criam-se objetos diferentes para cada uma das espcies presentes na matriz de dados e depois  calculada a abundncia total. 

3. STEP3= Calculam-se valores de riqueza de espcies para as duas categorias de "localidade"= urbana vs. rural

4. STEP4= Primeira parte: Se faz um sumrio das espcies vs. os criadouros vs. nmero de indivduos em cada criadouro.
          Segunda parte: Se estima a Riqueza de espcies para cada um dos criadouros na matriz de dados

5. STEP5= Dados complementares. Ou seja, sao funoes simples que ajudam a investigar relaoes entre as diferentes variveis, e que sao dadas de forma adicional  funao exploratria.
          Os resultados destas analises complementares apresentam grficos de relaao entre variveis.

6. STEP 6= Analise entre Altitude vs. Espcies (apresenta um boxplot)

7. STEP6.1= Analise de Localidade vs. Espcies (apresenta grafico de barras)

8. STEP6.2= Analise de Criadouro vs. Localidade (apresenta grafico de barras)

9. STEP6.3= Analise de Altitude vs. Criadouro (apresenta um boxplot)

10.STEP6.4= Analise de Alittude vs. Localidade (boxplot)

11. STEP 6.5= Analise de Localidade vs. Altitude (An. varincia)

12. STEP 6.6.= Analise de Espcie vs. Altitude (An. varincia)


Note:

   Para uma melhor compreensao desta analise exploratria, confira o documento anexo Analisexploratoria.r, com todos os cdigos utilizados.

Author(s):

Carolina Torres Gutierrez
aniloract@gmail.com

References:
Montes, Joyce. (2005). Fauna de Culicidae da Serra da Cantareira, So Paulo, Brasil. 
Revista de Sade Pblica, 39(4), 578-584. Retrieved April 23, 2012, 
from http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0034-89102005000400010&lng=en&tlng=pt. 
http://dx.doi.org/10.1590/S0034-89102005000400010. 


Examples:

  Use o arquivo "dadosculex.csv" e siga os cdigos do arquivo Analisexploratoria.r


